Храм Иоакима и Анны являлся частью Якиманского монастыря, который был упразднен в 1764г. в связи с церковной реформой.
В конце XVIII века имелся храм-придел святителя Леонтия епископа Ростовского Чудотворца и имел со старой церковью одну общую стену. В XIX веке храм Иоакима и Анны стал совсем ветхим и его пришлось полностью снести, осталась лишь северная стена, которая одновременно для Леонтьевского храма была южной, а придел превратился в самостоятельный храм. Третий по счету храм Иоакима и Анны был построен в 1871 году и никогда не закрывался . Если можно так сказать, то храм относительно благополучно выдержал времена гонений на церковь и годы войны, сохранил внутреннее убранство и святыни. В тоже время «старая» церковь со стеной древнего собора ,в советские годы была закрыта и использовалась как архив.
Сейчас церковь Иоакима и Анны это два хра,меньший из белого кирпича и имеет фрагмент стены ,являющейся частью Якиманского монастыря. И более современный храм, построенный в 1871г., архитектором Гриневским К.В., и представляет собой причудливое смешение стилей барокко, классицизма и псевдоготики.
